理研セミナー

高度好熱菌 丸ごと一匹 プロジェクト
第３回 連携研究会

2004年7月30日(金) ～ 8月1日(日)


　　　　　　

1. アノテーションおよび配列の閲覧ソフトウエアの Thermus ｔhermophilus HB8 ゲノムデータへの適用

丸山有紀, 山下英俊, 鈴木徹, 小松龍太, 北川正成
（タカラバイオ（株） ドラゴンジェノミクスセンター）

2-13. 理研播磨研での高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクトの進捗状況

2. 高度好熱菌 Thermus thermophilus HB8 の比較ゲノム解析

増井良治1,2, 黒川顕3, 中川紀子1,2, 寺田貴帆4, 白水美香子4, 小山芳典5, 徳永史生1, 大島泰郎6, 安永照雄5, 三木邦夫2,7, 横山茂之2,4, 倉光成紀1,2,4
（1阪大・院理, 2理研・播磨研, 3阪大・遺情研, 4理研・GSC, 5産総研, 6東薬大・生命科学, 7京大・院理）　　

3. タンパク質発現　

真岡伸子，甲角幸秀, 黒石千寿　他
（理研・播磨研）

4. タンパク質精製　

真岡伸子, 黒石千寿　他
（理研・播磨研）

5. 精製レポート１　

新海ふじ江, 真岡伸子　他
（理研・播磨研）

6. 精製レポート２　

大森美和, 西田雅美　他
（理研・播磨研）

7. 精製レポート３　

井上由美子, 満足美穂　他
（理研・播磨研）

8. 精製レポート４　

松永笑子, 藤本弥生　他
（理研・播磨研）

9. 精製レポート５　

伊東紀子, 浮田陽子　他
（理研・播磨研）

10. タンパク質結晶化　

飯野均　他
（理研・播磨研）

11. 構造機能解析　

金川真由美　他
（理研・播磨研）

12. DNAマイクロアレイ解析　

柏原愛子　他
（理研・播磨研）

13. 高度好熱菌 Thermus thermophilus HB8 に関する実験情報を管理・共有するためのデータベースシステム　

上利佳弘, 吉良聡　他
（理研・播磨研）

14. Thermus thermophilus HB8 用に開発された Web base のアノテーションシステムの利用方法

福崎昭伸1,2, 小西史一1,2, 長嶋剛志1, 井手香1,2, 畠山眞里子1,2, 倉光成紀2,3, 小長谷明彦1,2
（1理研 GSC, 2理研 播磨研, 3阪大 院理）

15. 協調的共進化アルゴリズムを用いた遺伝子ネットワークの同定

木村周平1,2, 畠山眞里子1,2, 小長谷明彦1,2
（1理研・GSC, 2理研・播磨研）

17. ビス（ターピリジン）ルテニウム（ＩＩ）錯体によるN端アミノ酸配列決定法の確立

増井健1, 岡村高明1, 山本仁1,2, 上山憲一1
（1阪大・院理, 2理研・播磨研）

18. フリーフロー等電点電気泳動法における3次構造解析向けの新規の両性電解質バッファーの開発

金成勲1, 宮武秀行1, 上野朋行2, 長尾卓也2, 三木邦夫1,3
（1理研・播磨研, 2Tecan Japan, 3京大・院理）

19. 示差走査熱量計 (DSC) による蛋白質試料のフォールディング評価

油谷克英1, 澤野雅英1, 竹平美千代1, 中村順司2, 田中智之1, 浮田陽子1, 横山茂之1,3,4
（1理研・播磨研, 2日本シイベルヘグナーKK, 3理研・GSC, 4東大・院理）

20. 生体高分子全自動結晶化・観察ロボットシステム HTS-80 の開発

宮武秀行1, 金成勳1, 茂木逸郎2, 松崎浩文2, 北原秀吉2, 樋口朗2, 三木邦夫1,3
（1理研・播磨研, 2パナソニックファクトリーソリューションズ（株）, 3京大・院理）

21. 理研構造ゲノムビームラインにおける大量凍結試料管理システム

上野剛1,2, 廣瀬雷太3, 井田孝1, 熊坂崇4, 山本雅貴1
（1理研・播磨研, 2理学電機（株）, 3ファルマアクセス（株）, 4東工大・生命理工）

23. タンパク質結晶構造における自動精密化ソフト Lafire

姚閔, 周勇, 田中勲
（北大・院理）

24. 蛋白質構造解析支援ソフトウエアの開発

浅田征彦1, 高秀幸1,2, 菅原道泰1, 阿山晴彦1, 卯川尚史1,2, 国島直樹1
（1理研・播磨研, 2日立ソフトウェアエンジニアリング）

25. Thermus thermophilus HB8 からの dehydroquinate synthase の結晶構造

菅原道泰, 野嶽勇一, 菅原光明, 国島直樹
（理研・播磨研）

26. Crystal Structure Of Indole-3-Glycerol Phosphate Synthase From Thermus thermophilus HB8

Bagautdin Bagautdinov, Yayoi Fujimoto, Tahir H Tahirov
（RIKEN Harima Inst.）

27. アセチルオルニチンアミノ基転移酵素の基質二重認識

宮原郁子1, 松村光義1,2, 後藤勝1, 近江理恵1, 広津建1,2
（1大市大・院理, 2理研・播磨研）

28. トレオニン脱水素酵素複合体のX線構造解析

矢尾忠之1,2, 近江理恵3, 後藤勝3, 宮原郁子1,2, 広津建1,2
（1大市大・院理, 2理研・播磨研）

29. 高度好熱菌ヒスチジノールリン酸ホスファターゼの結晶構造

近江理恵1, 後藤勝1, 宮原郁子1,2, 広津建1,2
（1大市大・院理, 2理研・播磨研）

30. 高度好熱菌 Thermus thermophilus 由来のホモイソクエン酸脱水素酵素の基質認識機構の解明

宮崎淳一1, 伏信進矢2, 西山真1
（1東大・生物工学センター, 2東大・院農生科）

31. 高度好熱菌 NDP kinase の構造機能解析

武石俊作1，中川紀子1,2，増井良治1,2，倉光成紀1,2
（1阪大・院理, 2理研・播磨研）

32. プリンヌクレオチド生合成系タンパク質の結晶構造解析

三瓶嚴一1,2, 馬場清喜3, 石井健1, 河合宏哉3, 矢内久陽1,2, 金川真由美2,3, 河合剛太2,3
（1電通大・量子物質工, 2理研・播磨研, 3千葉工大・工）

33. 高度好熱菌 Thermus thermophilus HB8 由来 GMP synthetase の結晶構造

石井健1, 馬場清喜2, 金川真由美2,3, 矢内久陽1,3, 河合宏哉2, 海老原章郎3, 中川紀子3, 河合剛太2,3, 三瓶嚴一1,3
（1電通大・量子物質工, 2千葉工大・工, 3理研・播磨研）

34. ビオチン依存酵素の立体構造・作用機構の解明

末田慎二1, モハマド ヌルル イスラム1, 金勇彪1, 近藤寛樹1,2
（1九工大・情報工, 2理研・播磨研）

35. GTP cyclohydrolase I の反応機構

田中容子1,2, 中川紀子1,2, 増井良治1,2, 倉光成紀1,2
（1理研・播磨研, 2阪大・院理）

36. ジヒドロネオプテリンアルドラーゼの結晶構造

久野玉雄1, 佐藤伸哉1, 三木邦夫1,2
（1理研・播磨研, 2京大・院理）

37. 高度好熱菌 Thermus thermophilus HB8 由来L-アスパラギン酸-α-デカルボキシラーゼの超高分解能による結晶構造解析

中島理1,2, 後藤勝1,3, 近江理恵1,3, 宮原郁子1,2, 広津建1,2
（1大市大・院理, 2理研・播磨研, 3阪大・院理）

38. 高度好熱菌 Thermus thermophilus HB8 由来 short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) の結晶学的研究

吉瀬智康1, 竹田一旗1, 久野玉雄1, 三木邦夫1,2
（1理研・播磨研, 2京大・院理）

39. 高度好熱菌由来 V-type ATPase C サブユニットの結晶構造

沼本修孝1, 喜田昭子1, 三木邦夫1,2
（1京大・院理, 2理研・播磨研）

40. 白金(II)錯体導入による Thermus thermophilus HB8 Thioredoxin 酵素活性阻害

加藤正弘1, 山本仁1,2, 岡村高明1, 増井良治1,2, 倉光成紀1,2, 上山憲一1
（1阪大・院理, 2理研・播磨研）

42. 水銀還元酵素の結晶構造解析

橋本博, 七條直記, 清水敏之, 佐藤衛
（横市大・総合理）

43. 高度好熱菌 Thermus thermophilus HB8 由来グリシン開裂系Ｐタンパクの結晶構造

中井忠志1,2, 中川紀子1,2, 真岡伸子1, 増井良治1,2, 倉光成紀1,2, 神谷信夫1
（1理研・播磨研, 2阪大・院理）

44. Thermus thermophilus 由来 Phosphomannomutase の結晶構造解析

岬真太郎1, 鈴木健司1, 国島直樹2, 菅原光明2, 黒石千寿2, 小林正則1, 藤本晶子1, 櫻井正博1, 西島和三1
（1蛋白質構造解析コンソーシアム共同研究G, 2理研 播磨研）

45. 好熱菌 Thermus flavus 由来リンゴ酸脱水素酵素と補酵素特異性改変体の補酵素特異性と触媒特性の解析

富田武郎1, 伏信進矢2, 西山真1
（1東大・生物工学センター, 2東大・院農生科）

46. Thermus thermophilus 由来カルボキシペプチダーゼ１の生化学的および結晶学的解析

筒井志穂1, 李愚哲1, 伊東孝祐1, 加茂昌之1, 井上由美子2, 永田宏次1, 田之倉優1,2
（1東大・院農生科, 2理研・播磨研）

47. Thermus thermophilus HB8 株由来 peptide deformylase の結晶構造解析

加茂昌之1, 工藤紀雄1, 李愚哲1, 本島浩之2, 田之倉優1,2
（1東大・院農生科, 2理研・播磨研）

48. 高度好熱菌 Thermus thermophilus HB8 由来ペプチドグリカン合成酵素群の結晶構造解析

小林祥平1, 松崎富士郎1, 広岡怜子1, 木村誠1,2, 角田佳充1,2
（1九大・院農, 2理研・播磨研）

49. 高度好熱菌 T. thermophilus HB8 由来 ABC トランスポーターのヌクレオチド結合タンパク質 (TT2939) の結晶構造解析

竹田一旗1, 三木邦夫1,2
（1理研・播磨研, 2京大・院理）

50. Thermus thermophilus HB8 由来 Glucose-inhibited division protein A の small form の結晶構造

岩崎わかな1, 宮武秀行1, 三木邦夫1,2
（1理研・播磨研, 2京大・院理）

70. MutS および MutL によって活性化される MutS2 のヌクレアーゼ活性

福井健二1, 増井良治1,2, 倉光成紀1,2
（1阪大・院理, 2理研・播磨研）

71. 高度好熱菌ヌクレオチド除去修復系の構造機能解析

齋藤郁美1, 中川紀子2, 増井良治1,2, 倉光成紀1,2
（1阪大･院理, 2理研･播磨研）

72. 高度好熱菌 Thermus thermophilus HB8 由来 endonuclease V の結晶化

山口瞳, 和田啓, 山形敦史, 高橋康弘, 福山恵一
（阪大・院理）

76. Thermus thermophilus HB８由来 TT1253 蛋白質のX線結晶構造解析

佐々木千津子1, 杉浦郁子1, 杉尾成俊1, 田村隆2,3, 稲垣賢二2,3
（1三菱化学（株）, 2理研・播磨研, 3岡大・院自然科学）

77. Thermus thermophilus TT1383 は dATP と dTTP によって誘導される dNTP triphosphohydrolase 活性を持つ

近藤直幸1, 中川紀子1,2, 増井良治1,2, 倉光成紀1,2
（1阪大・院理, 2理研・播磨研）

78. 高度好熱菌由来 ADP-ribose pyrophosphatase の変異体解析

大賀拓史1, 葭葉幸子1, 中川紀子1,2, 増井良治1,2, 倉光成紀1,2
（1阪大・院理, 2理研・播磨研）

79. 高度好熱菌由来 Ndx3 蛋白質の機能解析

西久保喬1, 増井良治1,2, 倉光成紀1,2
（1阪大・院理, 2理研・播磨研）

80. 高度好熱菌由来 Nudix タンパク質 Ndx2 の機能解析

若松泰介1, 大賀拓史2, 中川紀子2, 増井良治2,3, 倉光成紀1,2,3
（1阪大・院生命機能, 2阪大・院理, 3理研・播磨研）

81. 高度好熱菌由来 Ndx７ の機能解析

山岸大輔1, 増井良治1,2, 倉光成紀1,2
（1阪大・院理, 2理研・播磨研）

82. 高度好熱菌 Thermus thermophilus のポリアミン生合成系の解析

大沼みお1, 照井祐介1, 永井瑞恵1, 伊藤浩美1, 千年絢1, 玉腰雅忠1, 横堀伸一1, 新津勝2, 鮫島啓二郎2, 大島泰郎1
（1東薬大・生命科学, 2城西大・薬）

83. 高度好熱菌 HB8 由来シグナル伝達蛋白質 GlnK の結晶構造

酒井宏明1, 王宏飛1, 竹本(堀)千重1, 上西達也1,2, 山口寛人1, 亀割友紀1, 寺田貴帆1,4, 倉光成紀1,3,4, 白水美香子1,4, 横山茂之1,2,4
(1理研・GSC, 2東大・院理, 3阪大・院理, 4理研・播磨研)