概要

これまでの「高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト連携研究会」では、モデル生物として高度好熱菌 Thermus thermophilus HB8 を利用したシステム生物学的研究に関する情報交換とともに、種々のモデル生物についての情報交換も行ってきました。その過程で、高度好熱菌のような単細胞生物の生命現象は、以前考えられていたよりもはるかに高等動植物と似かよっていることもわかってきました。また、いずれの生物種においても、タンパク質（遺伝子）の1/3-1/2 が「機能未知」の状態で残されており、その状況は生命現象をシステムとして理解する際の障害となっています（倉光成紀 (2008) 生化学 80, 1075-1075; (2009) 生産と技術 61, 17-26）。それら機能未知タンパク質の中で、動植物から微生物まで共通で重要な働きをしていると考えられるタンパク質でさえも、まだ約200種類が機能未知の状態で残されています。それらの機能がいずれかの生物種で分かれば、他の生物種のシステムを理解する際にも役立ちます。

それら機能未知タンパク質の機能推定には、立体構造情報が威力を発揮することがわかってきましたが、その他の機能推定法として、ゲノムワイドな機能解析（トランスクリプトミックス、プロテオミックス、メタボロミックスなど）なども利用されています。

一方、タンパク質の立体構造が多くの研究者の協力によって明らかにされた結果、フォールド単位ならタンパク質の立体構造が75%以上予測可能な時代になり（Kaufmann, K. W. et al. (2010) Biochemistry, 49, 2987-2998; Levitt, M (2009) Proc. Natl Acad. Sci. USA, 106, 11079-11084; CASP9 in 2010 (2011) Proteins 79 (suppl. 10) 1-207）、分子の立体構造をもとにして生命現象を化学的に理解できる範囲が、飛躍的に拡大されつつあります。それによって、生命現象をシステムとして原子分解能で理解する時代が始まりつつあります。

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2012.10.05 ホームページ開設